知网查重系统和paperbye论文查重系统都是常见的论文查重工具，二者之间有以下几个区别：

1. 数据库不同：知网是一个主要支持中文学术文献数据库，其查重系统检测的文献主要来自知网数据库和互联网上的公开资源；而paperbye则是一款中英文多语种论文查重系统，其主要使用优秀硕博毕业论文，学术期刊及Turnitin数据库等进行文献匹配。

2. 报告输出不同：知网查重系统输出的报告主要包含论文相似度比例和文献来源，以及相似的文本片段和相同的参考文献；而paperbye系统的报告不仅包含相似段落的标注和匹配比例，还可以对不同类型的错误（例如错别字、缺少引用、引用格式错误等）给出建议性修改。

3. 价格不同：知网查重系统的使用需要购买知网的服务，价格相对较高，而paperbye则推出多种套餐，可以根据自己的需求和预算进行选择。

4. 支持的文档类型和语言略有区别：知网查重系统主要支持中文英文等文献的检测，可以检测课程论文、期刊论文、硕士论文和博士论文等；而paperbye则主要支持中英文及多语种论文的检测，并支持的文档类型包括、Word、TXT等。

总的来说，知网查重系统适合用于中文文献的检测，而paperbye则适合用于多语种文论文的检测。此外，两个工具的检测结果也有一定的差异，用户在选择时可以根据自己的实际需求进行选择。