论文修改后重复率变高的可能原因有以下几点：

1.未彻底删除原文内容：在修改论文时，有时可能会忘记删除原文内容，导致论文中出现了重复内容。因此，在进行修改时，一定要非常仔细地检查每个段落，确保已经将原文的内容完全删除。

2.引用格式出现问题：论文中的引用格式如果不正确，也可能导致重复率增高。建议使用一种权威的引用格式，如APA、MLA或Chicago，同时在完成时再次检查引用格式。

3.使用了过于相似的词汇和短语：在修改过程中，有时会保留使用相似的词汇和短语，而这些相似词汇和短语也会被视为重复内容。因此，在修改时应该使用各种工具检查每个句子和段落，确保已经对它们进行了足够的修改和改变。

4.与其他人的写作重叠：如果从其他来源获得的信息与其他人的写作产生了重叠，那么您的重复率也可能会增加。这就说明需要更加仔细地审查论文的内容，以确保它不但准确无误，在写作方式上也要与其他人保持独立性。

5.使用了缩写：缩写词会被检测出来，并被视为任何其他单词。因此，如果您在使用缩写时不加小括号并首次给出缩写的全称，检测工具会认为您省略了此部分并将其视为重复内容。

6.复制粘贴错误：修改论文时，您可能会复制粘贴某些段落或句子，却忘记修改其中的部分内容，导致出现内容重复的情况。

7.被误认为是意外重复：有些检测工具很容易出现误判，将某些内容误判为重复内容，尤其当重复内容中有一些常见的短语或单词时。

因此，在您使用任何检测工具检查论文重复率时，一定要仔细检查，确定每个重复部分都是有意为之，而不是误操作或者误判。在修改论文时，建议采用多种工具检查重复率，以获得更准确的结果并尽可能地降低重复率。

不要担心修改后出现重复率增高的情况。只要您按照规范的写作流程进行修改，认真检查并采取相应的措施来避免重复，就能降低重复率，提高论文的质量。