两次的论文查重结果不同可能是由于以下几个原因造成的：

1. **数据库更新**: 论文查重系统的文献数据库可能会不断更新，加入新的文献或移除旧的文献，导致每次查重的比对对象不完全相同，造成查重结果的差异。

2. **算法误差**: 论文查重系统使用的比对算法有时可能存在一定的误差，不同的检测算法或参数设置可能导致不同的结果。因此，同一篇文章在不同时间或不同平台上查重可能出现结果不同的情况。

3. **文字识别差异**: 如果上传的文档是图片格式或非常规格式（如扫描版、手写稿等），查重系统对其进行文字识别的质量可能会有差异，导致不同的查重结果。

4. **查重阈值设置**: 不同的论文查重系统可能设定了不同的相似性阈值，只有当相似度达到一定程度才会被标记为重复内容。在设定查重阈值时的不同设定也会影响查重结果的不同。

5. **语言处理差异**: 有些查重系统可能会针对不同语种或语言进行特定的处理和比对，导致中英文文本查重差异显现。

6. **上传文档差异**: 如果两次查重的上传文档存在细微差异（如格式、编码、文字排版等），也有可能导致查重结果不同。

7. **系统设置和规则**: 不同的论文查重系统可能采用不同的系统设置和比对规则，如是否排除引文、是否考虑公共领域内容等。这些设置和规则的差异也可能导致不同的查重结果。

8. **查重范围**: 查重系统可以针对全文进行比对，也可以选择只比对特定部分（如摘要、引言、正文等）。如果两次查重的范围不一样，也会导致不同的结果。

9. **查重工具的精度和准确性**: 不同的查重工具的准确性和精度也可能存在差异，其中一些工具可能更加敏感或更严格地判断相似度，从而产生不同的结果。

10. **人为因素**: 有时候查重结果的差异可能是由于人为因素造成的，比如操作不当、输入错误或误解查重报告等。因此，在使用查重工具时，确保正确操作、仔细阅读并正确理解查重报告是很重要的。

因此，在进行论文查重时，建议保持文档的稳定性和准确性，确保文档格式规范，识别清晰，最大程度避免以上因素可能带来的查重结果差异。同时可以尝试多次查重并综合分析结果，以更好地评估和优化论文的原创性和学术质量。