本文旨在探讨毕业论文是否可以使用手动制作的目录，并关注论文查重。通过对相关文献的研究，我们发现手动制作的目录在毕业论文中是可行的，但也需要注意一些问题。

手动制作的目录可以提高毕业论文的可读性和组织性。通过手动编排目录，作者可以更好地呈现论文的结构和内容，读者可以快速地获取到关键信息，为论文的阅读和理解提供便利。

手动制作的目录可以减少论文查重的问题。对于使用论文查重系统的学位论文，系统一般会自动生成目录。但是，部分论文查重系统可能对目录的格式要求较高，如要求目录中的页码与正文一致。手动制作目录可以确保目录的格式满足系统的要求，降低查重时出现格式不符的情况。

手动制作目录也存在一些潜在的问题。首先，手动制作目录可能会存在漏项或错项的风险，需要作者仔细核对。其次，随着论文内容和结构的调整，手动制作的目录可能需要多次修改，增加了一定的工作量和时间成本。

毕业论文可以使用手动制作的目录，但需要作者注意检查目录内容的准确性和完整性，并确保满足论文查重系统的要求。此外，作者还可以结合使用论文编辑软件等工具，提高目录制作的效率和准确性。