毕业论文查重的方法多种多样，以下是一些主要的方法：

一、在线查重系统

目前市场上存在多种在线查重平台，如PaperBye、维普查重、万方查重等。这些系统通常需要用户上传论文文档，然后通过系统内置的算法与数据库中的文献进行比对，生成查重报告。使用在线查重系统时，应注意选择正规可靠的平台，并保护个人隐私和论文安全。

二、学校或机构查重服务

许多高校和研究机构都会提供论文查重服务，学生和研究人员可以登录学校提供的系统进行查重。这些服务通常与学校图书馆资源相结合，可能包括Turnitin、Grammarly等国际查重软件。使用学校或机构的查重服务通常更为便捷和安全，且可能享受免费或优惠的查重机会。

三、文献管理软件查重

一些文献管理软件，如EndNote、NoteExpress等，也提供查重功能。用户可以将引用的文献导入软件，然后通过软件的查重功能检测论文中的引用部分是否重复。这种方法适用于需要管理大量文献并检查引用重复性的情况。

四、手动查重

对于一些特定的内容，可以通过搜索引擎手动查找是否有相似的文献或内容。这种方法耗时较长，但可以更精确地控制查重过程，并发现一些在线查重系统可能无法检测到的重复内容。然而，手动查重的效率和准确性受限于个人的搜索能力和时间投入。

五、文本比对工具

一些文本比对工具，如WinMerge、DiffChecker等，可以用来比较两个文档的相似度。这种方法适用于小篇幅内容的比对，如论文中的某个段落或章节。对于整篇论文的查重，这种方法可能不太实用。

六、专业编辑服务查重

有些专业编辑服务在编辑论文的同时，也会提供查重服务，帮助作者识别并修改重复内容。这种方法可以确保论文的语言质量和学术诚信，但可能需要支付一定的费用。

综上所述，毕业论文查重的方法多种多样，可以根据实际情况选择合适的方法。同时，应注意保护个人隐私和论文安全，避免泄露给不安全的平台或人员。在查重过程中，应认真对待查重报告，对重复部分进行适当的修改，以确保毕业论文的学术诚信和质量。